El Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (Senasica), la Dirección General de Inocuidad Agroalimentaria, Acuícola y Pesquera (DGIAAP), el Centro Nacional de Referencia de Inocuidad y Bioseguridad Agroalimentaria (CNRIBA) en alianza estratégica con Biosystems Corp., tienen el honor de invitar a la comunidad científica, investigadores y estudiantes de posgrado a participar en el 1° Concurso de Innovación en Secuenciación Bacteriana.
Esta iniciativa tiene como propósito impulsar la investigación genómica en México, facilitando el acceso a tecnologías de secuenciación de tercera generación (lecturas largas) para resolver problemáticas actuales en los sectores de inocuidad alimentaria.
OBJETIVO
Otorgar el servicio de secuenciación de genoma completo bacteriano (WGS) a proyectos de alto impacto científico, utilizando tecnología de punta para lograr ensamblajes de alta calidad, caracterización de plásmidos y detección de resistencia antimicrobiana, en proyectos de inocuidad alimentaria.
BASES DE PARTICIPACIÓN
Elegibilidad
Podrán participar investigadores, profesionales y estudiantes de maestría o doctorado adscritos a instituciones nacionales (públicas o privadas) que cuenten con muestras biológicas (aislados bacterianos) listas para la extracción o con ADN ya extraído.
El Premio (Beneficios)
Los proyectos ganadores recibirán la secuenciación de un genoma bacteriano a través tecnología de Oxford Nanopore Technologies. El premio incluye:
- Preparación de librerías para secuenciación de lecturas largas (Long-reads).
- Secuenciación en plataforma Nanopore (GridION) para garantizar alta cobertura.
- Reporte bioinformático básico: Ensamblaje de novo y anotación preliminar.
Requisitos Técnicos de la Muestra
Dado que la tecnología Oxford Nanopore depende de la integridad de la molécula de ADN, es indispensable cumplir con los siguientes estándares de calidad:
- Estado: ADN genómico de Alto Peso Molecular (HMW), libre de ARN y contaminantes.
- Concentración mínima: 50 ng/µl (Qubit).
- Cantidad total mínima: 1.5 µg de ADN total.
- Volumen mínimo: 30 µl.
- Pureza:
- Relación OD 260/280: 1.8 – 2.0
- Relación OD 260/230: 2.0 – 2.2
- Integridad: Banda nítida y superior a 20 kb visualizada en gel de electroforesis (sin barrido o degradación visible).
MÉTODO DE EVALUACIÓN Y SELECCIÓN
La selección se basará en la capacidad del investigador para comunicar la relevancia científica y social de su proyecto. Los participantes deberán grabar un video de mínimo 2 y máximo 5 minutos.
Contenido del Video:
- El Desafío (Contexto): ¿Cuál es la problemática de inocuidad, sanitaria, agrícola o biotecnológica que aborda?
- El Protagonista (La Muestra): Descripción biológica del microorganismo. ¿Por qué es único o interesante?
- La Solución (Impacto de Nanopore): ¿Por qué necesitas lecturas largas? ¿Cómo ayudará la secuenciación de este genoma específico a resolver el problema planteado? (Ej. Cerrar el genoma, encontrar plásmidos complejos, variantes estructurales).
Nota: No se evaluará la calidad de producción audiovisual, sino la claridad del mensaje, la solidez científica y el entusiasmo del ponente.
PROCESO DE REGISTRO
- Subir el video a una plataforma digital (YouTube, Vimeo, Google Drive) asegurando que el enlace sea público o accesible mediante link.
- Completar el formulario de registro en: https://forms.gle/1nS9vyAeHfEKr2HY7 adjuntando el enlace del video y los datos del investigador.
- Fecha límite de recepción: 10 de enero de 2026 a las 23:59 horas (Hora CDMX).
RESULTADOS Y PREMIACIÓN
Un comité evaluador conformado por especialistas de Senasica, Biosystems Corp. y Oxford Nanopore Technologies seleccionará las mejores propuestas.
- Anuncio de Ganadores: 20 de enero de 2026, durante el evento “Foro Genómica en Acción: el Poder de Secuenciar con 3G al Servicio de la Inocuidad».
- Condiciones: La presencia de los finalistas (virtual) en el evento es deseable para la recepción simbólica del premio.
Fecha de secuenciación: Los ganadores serán contactados directamente para iniciar la fase de coordinación. Esta fase incluirá la especificación y programación de la entrega de las muestras, así como la verificación de los requisitos de calidad y cuantificación necesarios.
Se estima que el proceso de secuenciación se llevará a cabo dentro de un plazo de uno a dos meses posteriores a la comunicación oficial de los resultados de la convocatoria.
CONTACTO Y DUDAS
Para consultas técnicas sobre la extracción de ADN o detalles administrativos:
- Senasica: dgiaap.iica44@senasica.gob.mx
- Biosystems Corp: info@biosystemcorp.com